💻 گاهی اوقات یکی از استپ‌های مقاله‌تون، می‌تونه رسم یک شبکه ceRNA یا یک شبکه تنظیمی miRNA باشه؛ برای این‌ کار نیاز دارید که اینتراکشن‌های بین miRNA موردنظر با mRNAها رو به دست بیارید؛ این کار رو می‌تونید به روش دستی و با استفاده از دیتابیس‌های مختلف یا با برنامه‌نویسی و کد زدن انجام بدید.

💻 تو روش دستی می‌تونید miRNA موردنظر رو تو دیتابیس‌هایی مثل miRwalk، TargetScan، miRDB و ... سرچ کنید و اینتراکشن‌هاش رو به دست بیارید.

💻 اما تو روش دوم، می‌تونید از پکیج multiMiR در R استفاده کنید؛ توجه کنید که تو آبجکت my_mirs، اسامی miRهای شما باید به‌صورت یک وکتور کاراکتر باشه.

library(multiMiR)
my_mirs <- read.delim(file = "miRs.txt",
                      header = TRUE)
miRt <- get_multimir(mirna = my_mirs,
                     summary = TRUE)
columns(miRt)

miRTargets <- multiMiR::select(x = miRt,
                               keys = my_mirs,
                               keytype = "mature_mirna_id",
                               columns = columns(miRt))
View(miRTargets)